Предсказание пути синтеза химического соединения и его аналогов

Уважаемая Татьяна, коэффициент Танимото отражает насколько одна молекула похожа на другую и изменяется в пределах от 0 до 1. Он расчитывается на основе молекулярных отпечатков — бинарных строк, которые кодируют отдельные структурные фрагменты молекулы (С=С, С=О, С-С-С и т.д.). Танимото равен 0, если две молекулы не имеют общих фрагментов, и 1 — если фрагменты совпадают. Таким образом, чем выше коэффициент Танимото, тем более высоким сходством обладают структуры. На рисунке 4 видим, что при Танимото=0.96 полученный продукт структурно похож на целевую молекулу (бевантолол), он отличается лишь орто-положением метокси-радикалов и дополнительным фрагментом CH2NHCH2.
Алгоритм предсказал путь для 5 молекул из 15 за определенное количество итераций. Это говорит о том, что база данных реакционных правил содержала подходящие трансформации для того, чтобы в конечном итоге получить целевую молекулу, а так же необходимые строительные блоки. Для оставшихся 10 молекул причин может быть несколько: недостаточно шагов итерации для получения пути синтеза конкретной молекулы (это зависит и от сложности молекулы, в том числе), необходимый реагент для определенной стадии мог отсутствовать в базе данных строительных блоков, и, возможно, что среди имеющихся реакционных правил не нашлось того самого, которое могло привести к целевой молекуле. Алгоритм можно улучшить внедрением в него методов машинного обучения, например, нейронной сети, которая будет предсказывать второй реактант для проведения двухкомпонентной химической реакции. Также планируется валидация реакционных правил, которые были извлечены автоматически.